Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms