Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HKR1P10072 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HKR1P10072 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HKR1P10072 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HKR1P10072 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms