Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC172P0C7W6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms