Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFT2D2O95562 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SFT2D2O95562 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SFT2D2O95562 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms