Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms