Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms