Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3KR12 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3KR12 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3KR12 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms