Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX1C9JBD0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms