Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms