Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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ARL2-SNX15V9GYD0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ARL2-SNX15V9GYD0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ARL2-SNX15V9GYD0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ARL2-SNX15V9GYD0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ARL2-SNX15V9GYD0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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