Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHOC2Q9UQ13 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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