Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF24Q9UPV7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF24Q9UPV7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF24Q9UPV7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF24Q9UPV7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF24Q9UPV7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF24Q9UPV7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHF24Q9UPV7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHF24Q9UPV7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHF24Q9UPV7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PHF24Q9UPV7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms