Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX12Q9UMY4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms