Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms