Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFIP11Q9UBB9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFIP11Q9UBB9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms