Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 BCOR-208ENST00000413905 1945 ntTSL 513.11□□□□□ -0.311e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.321e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CYTH2-208ENST00000474049 576 ntTSL 212.97□□□□□ -0.331e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 SAP30BP-214ENST00000580601 2786 ntTSL 212.9□□□□□ -0.341e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.381e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.382e-10■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 MCM2-202ENST00000468414 1076 ntTSL 212.28□□□□□ -0.441e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.451e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.451e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.471e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.481e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 UNC93A-202ENST00000366829 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.481e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.481e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 MADD-206ENST00000402192 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.51e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 TRAF3IP1-204ENST00000462122 922 ntTSL 311.81□□□□□ -0.521e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.529e-27■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 MADD-210ENST00000407859 5744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.531e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CIZ1-219ENST00000485001 596 ntTSL 311.6□□□□□ -0.551e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 BCOR-204ENST00000378463 2230 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.581e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 TPCN1-210ENST00000547955 609 ntTSL 511.37□□□□□ -0.591e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 SGSM2-211ENST00000574563 3410 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.61e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 BCAM-207ENST00000590108 429 ntTSL 211.32□□□□□ -0.61e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 MADD-202ENST00000342922 6005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.61e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 COG4-203ENST00000482252 2953 ntTSL 211.29□□□□□ -0.69e-27■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 COG4-201ENST00000323786 2833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.629e-27■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CPT1A-206ENST00000540367 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.621e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 MTR-205ENST00000535889 10405 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.621e-8■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 GPBP1L1-202ENST00000355105 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.621e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 ACACB-201ENST00000338432 9360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.641e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 COG4-211ENST00000564415 3000 ntTSL 510.9□□□□□ -0.669e-27■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 BCOR-210ENST00000442018 2189 ntTSL 210.89□□□□□ -0.671e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CHD3-208ENST00000470531 3744 ntTSL 210.89□□□□□ -0.671e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 MTR-202ENST00000366577 10529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.671e-8■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 ACACB-202ENST00000377848 9247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.671e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 PEX5-212ENST00000539304 708 ntTSL 210.79□□□□□ -0.681e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 PEX5-202ENST00000266564 3170 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.711e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CPT1A-201ENST00000265641 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.711e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 SAP30BP-203ENST00000542343 1011 ntTSL 210.6□□□□□ -0.711e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 TNIP1-210ENST00000521423 926 ntTSL 510.53□□□□□ -0.721e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 ZNF526-201ENST00000301215 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.731e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CHD3-201ENST00000330494 7328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.731e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 MADD-219ENST00000524530 566 ntTSL 510.42□□□□□ -0.741e-5■■■■□ 22.7
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RBM22Q9NW64 NDUFA9P1-201ENST00000436210 1135 ntBASIC10.32□□□□□ -0.761e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.771e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 COG4-207ENST00000530314 3488 ntTSL 1 (best)10.09□□□□□ -0.799e-27■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 RBFOX2-202ENST00000359369 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.821e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CHD3-202ENST00000358181 7286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.831e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CIZ1-213ENST00000471839 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.76□□□□□ -0.851e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 SAP30BP-208ENST00000578909 678 ntTSL 59.37□□□□□ -0.911e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 LNPK-205ENST00000445472 639 ntTSL 49.24□□□□□ -0.931e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 UNC93A-205ENST00000504706 831 ntTSL 39.01□□□□□ -0.971e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 ACACB-203ENST00000377854 6588 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.971e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 MTR-203ENST00000463959 1972 ntTSL 58.66□□□□□ -1.021e-8■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 BCOR-209ENST00000427012 1969 ntTSL 58.64□□□□□ -1.031e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CNN3-205ENST00000474409 544 ntTSL 38.49□□□□□ -1.051e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 STN1-203ENST00000466828 1414 ntTSL 58.48□□□□□ -1.051e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.051e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 NXN-207ENST00000574018 508 ntTSL 38.35□□□□□ -1.071e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 LNPK-206ENST00000466445 554 ntTSL 48.35□□□□□ -1.071e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 UBE2M-204ENST00000596985 349 ntTSL 38.3□□□□□ -1.081e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 PIK3C3-204ENST00000586545 1554 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.091e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 MADD-220ENST00000524686 580 ntTSL 48.14□□□□□ -1.111e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CIZ1-212ENST00000471773 717 ntTSL 28.04□□□□□ -1.121e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 UBE2M-205ENST00000599829 447 ntTSL 37.76□□□□□ -1.171e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 RBFOX2-206ENST00000408983 663 ntTSL 37.62□□□□□ -1.191e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 UBE2M-202ENST00000593801 323 ntTSL 37.52□□□□□ -1.211e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.231e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 SAP30BP-210ENST00000579864 868 ntTSL 37.21□□□□□ -1.261e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.341e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 IDE-206ENST00000478361 3198 ntTSL 1 (best)6.33□□□□□ -1.41e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 SAP30BP-218ENST00000583063 538 ntTSL 46.12□□□□□ -1.431e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 GPBP1L1-206ENST00000479235 3121 ntTSL 25.7□□□□□ -1.51e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 GPBP1L1-209ENST00000487436 560 ntTSL 25.68□□□□□ -1.51e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.551e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 PIK3C3-213ENST00000590220 168 ntTSL 35.31□□□□□ -1.561e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 PIK3C3-203ENST00000585528 533 ntTSL 55.29□□□□□ -1.561e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.591e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 GPBP1L1-205ENST00000468724 559 ntTSL 34.49□□□□□ -1.691e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 GPBP1L1-204ENST00000467032 592 ntTSL 24.17□□□□□ -1.741e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 KDM3A-213ENST00000488971 975 ntTSL 32.75□□□□□ -1.971e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.061e-5■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 HNRNPU-208ENST00000475997 5290 ntTSL 56.04□□□□□ -1.442e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 HNRNPU-221ENST00000639824 1450 ntTSL 511.49□□□□□ -0.571e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 HNRNPU-207ENST00000468690 5273 ntTSL 57.94□□□□□ -1.141e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 215.79■□□□□ 0.121e-7■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 U2SURP-201ENST00000461591 1580 ntTSL 22.55□□□□□ -23e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.297e-7■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 HDLBP-237ENST00000479169 1017 ntTSL 210.85□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 SORBS3-217ENST00000523402 889 ntTSL 315.64■□□□□ 0.091e-8■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.464e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.364e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.244e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 CBFB-206ENST00000565389 846 ntTSL 1 (best)9.08□□□□□ -0.964e-6■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 FN1-223ENST00000490833 699 ntTSL 36.42□□□□□ -1.389e-25■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 FN1-221ENST00000480737 384 ntTSL 22.56□□□□□ -29e-25■■■■□ 22.7
RBM22Q9NW64 SKP1-206ENST00000519321 692 ntTSL 322.88■■□□□ 1.258e-8■■■■□ 22.7
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