Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT84Q9NSB2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms