Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ15

NABP2, SOSS complex subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NABP2Q9BQ15 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NABP2Q9BQ15 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP2Q9BQ15 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms