Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3AQ99856 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID3AQ99856 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms