Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF2Q99496 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF2Q99496 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF2Q99496 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms