Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms