Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms