Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C17orf47Q8NEP4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C17orf47Q8NEP4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms