Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APCDD1LQ8NCL9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms