Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDPD3Q7L5L3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDPD3Q7L5L3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDPD3Q7L5L3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDPD3Q7L5L3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDPD3Q7L5L3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDPD3Q7L5L3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDPD3Q7L5L3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDPD3Q7L5L3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDPD3Q7L5L3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDPD3Q7L5L3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDPD3Q7L5L3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDPD3Q7L5L3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDPD3Q7L5L3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDPD3Q7L5L3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDPD3Q7L5L3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDPD3Q7L5L3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDPD3Q7L5L3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms