Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PREX2Q70Z35 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PREX2Q70Z35 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms