Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TTC41PQ6P2S7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms