Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REEP3Q6NUK4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms