Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms