Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF4Q2M2E3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF4Q2M2E3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms