Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TCEA2Q15560 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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