Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms