Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPNMBQ14956 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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GPNMBQ14956 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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GPNMBQ14956 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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GPNMBQ14956 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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