Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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CDK5R2Q13319 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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CDK5R2Q13319 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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CDK5R2Q13319 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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CDK5R2Q13319 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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CDK5R2Q13319 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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CDK5R2Q13319 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5R2Q13319 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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