Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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SEMA3FQ13275 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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