Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL28Q13084 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms