Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SRSF11Q05519 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms