Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSC2Q02487 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms