Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GNB1P62873 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNB1P62873 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNB1P62873 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms