Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RND3P61587 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RND3P61587 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RND3P61587 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms