Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RORCP51449 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RORCP51449 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms