Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRIM1P49642 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRIM1P49642 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms