Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU3F4P49335 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms