Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCC3P46736 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms