Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-1P43699 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-1P43699 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms