Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCAP37840 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCAP37840 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCAP37840 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCAP37840 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCAP37840 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCAP37840 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCAP37840 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCAP37840 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCAP37840 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCAP37840 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCAP37840 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCAP37840 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCAP37840 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCAP37840 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCAP37840 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCAP37840 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCAP37840 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNCAP37840 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNCAP37840 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNCAP37840 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNCAP37840 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNCAP37840 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNCAP37840 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNCAP37840 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNCAP37840 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNCAP37840 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNCAP37840 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNCAP37840 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms