Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME2P23368 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME2P23368 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME2P23368 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ME2P23368 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ME2P23368 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ME2P23368 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME2P23368 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME2P23368 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME2P23368 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME2P23368 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME2P23368 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME2P23368 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME2P23368 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME2P23368 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME2P23368 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME2P23368 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms