Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DPA1P20036 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DPA1P20036 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DPA1P20036 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DPA1P20036 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DPA1P20036 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DPA1P20036 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DPA1P20036 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DPA1P20036 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DPA1P20036 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DPA1P20036 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DPA1P20036 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DPA1P20036 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-DPA1P20036 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-DPA1P20036 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-DPA1P20036 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DPA1P20036 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms