Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM21P19474 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms