Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA1P15085 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA1P15085 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA1P15085 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA1P15085 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA1P15085 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA1P15085 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA1P15085 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA1P15085 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA1P15085 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA1P15085 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA1P15085 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA1P15085 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA1P15085 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA1P15085 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA1P15085 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA1P15085 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA1P15085 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA1P15085 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA1P15085 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA1P15085 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA1P15085 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA1P15085 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA1P15085 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA1P15085 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA1P15085 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms